Mae gwregys cynaeafwr pupur yn fath o wregys a ddefnyddir ar gynaeafwr pupur, a ddefnyddir yn bennaf mewn cynaeafwr pupur, cynaeafwr sbwriel hunanyredig, cynaeafwr pupur, peiriant cynaeafu pupur ac ati.
Gan fod y gwregys cynaeafu pupur yn aml yn cael ei weithredu mewn tir fferm awyr agored, mae'r amgylchedd gwaith yn fwy llym a graeanog, sy'n achosi difrod enfawr i'r gwregys.